学会発表など

 

2024年度

招待講演・講習会など

  1. 2.山本義治　（ナズナアクセション間のTSS比較解析）　第４７回日本分子生物学会年会シンポジウム「種内多様性の分子基盤や成立過程の解明に向けて」 2024.11.26-9（福岡）

  2. 1. 日本遺伝学会第９６回高知大会ワークショップ「細胞内共生と細胞進化を支えるゲノム機能とその変遷」2024.9.4-6（高知）世話人：山本義治、遊佐陽一　<<国際細胞共生学会後援>>


学会発表


2023年度


招待講演・講習会など

  1. 3.山本義治「予測に基づくABA応答性プロモーターの再構築」2023.11.1 信州大学遺伝子実験施設セミナー

  2. 2.Yoshiharu Y. Yamamoto, “Synergetic activation of Arabidopsis ELIP2 expression by high light and cold stress”,  Mini-Symposium on Plant Photomorphogenesis, 2023.10.17, National Taiwan University, Taipei, Taiwan

  3. 1.Yoshiharu Y. Yamamoto, “Synergetic activation of Arabidopsis ELIP2 expression by high light and cold stress” The 15th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis (ICE2023), 2023.9.10-14, Field Museum, Chicago, USA


学会発表

  1. 3.三田井香菜、Ezeh Okechukwu Samson、速水菜月、小玉和靖、井内聖、山本義治「強光・低温の複合ストレス応答を担うシロイヌナズナプロモーターの制御機構の解析」第６５回日本植物生理学会年会2020.3.17-19（神戸）

  2. 2.菅川和貴、Ezeh Okechukwu Samson、山本義治　「シロイヌナズナ野生型４系統のTSS比較解析」ポスター発表 第６５回日本植物生理学会年会2020.3.17-19（神戸）

  3. 1.Ezeh Okechukwu Samson, Kana Mitai, Natsuki Hayami, Wase Kodama, Satoshi Iuchi, Yoshiharu Y. Yamamoto, “A unit of two elements activated by the cold, high light, and UV-B stress signals”  Taiwan-Japan Plant Biology2023 (TJPB2023) 2023.10.13-16 (Taipei, Taiwan)

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2022年度


招待講演・講習会など

  1. 2.Yoshiharu Y. Yamamoto, Natsuki Hayami, “Evaluation of the promoter context in plants and trials for prediction of gene expression in the fields based on expression data in lab” 産総研北海道センター　2022.9.16 （札幌）

  2. 1.Yoshiharu Y. Yamamoto, “Sequence-based evaluation of promoter context for prediction of transcriptional start sites in Arabidopsis and rice ”  Seminar MIPA Talk Series at Faculty of Mathematics and Natural Sciences in University of Indonesia  2022.8.30 (Depok, Indonesia)


学会発表

  1. 5.三田井香菜、 Ezeh Okechukwu Samson、 速水菜月、小玉和靖、井内聖、山本義治　「低温強光UV-B応答を全て担うシロイヌナズナのシス因子機能ユニット」 第６４回日本植物生理学会年会2023.3.15-17（仙台）

  2. 4.速水菜月、草野都、圓山恭之進、永野淳、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治　「ラボでのトランスクリプトームデータを用いた野外植物の温度応答の予測」第６４回日本植物生理学会年会2023.3.15-17（仙台）

  3. 3.三田井香菜、速水菜月、小玉和靖、Ezeh Okechukwu Samson、井内聖、山本義治　「シロイヌナズナの低温強光UV-B応答を全て担うシス因子機能ユニット」 日本遺伝学会第９４回札幌大会 2022.9.14-15（札幌）

  4. 2.速水菜月、草野都、圓山恭之進、永野淳、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治　「成長時におけるシロイヌナズナの温度適応の解析とラボデータによるフィールドトランスクリプトーム予測」 日本遺伝学会第９４回札幌大会 2022.9.14-15（札幌）

  5. 1. 平塚柊星、蒔田由布子、山本義治　「塩基配列をもとにした植物プロモーターコンテクストの定量と転写開始点予測」日本遺伝学会第９４回札幌大会 2022.9.14-15（札幌）


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2021年度

学会発表

  1. 1.Yingxi Chen, Nishimura K, Yamamoto YY, Masuida S, “Light- and tissue-dependent regulation of transcriptional start sites of HO1 in Arabidopsis thaliana” 日本植物学会第８５回大会 2021.9.16-20, （八王子）


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2020年度



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2019年度

学会発表

  1. 2.土屋沢実、趙成日、Smita Sahoo、Sanjib K. Panda、速水菜月、圓山恭之進、井内聖、田邊良也、山本義治「ABA応答を担う合成プロモーターの設計と環境特異性」　第６１回日本植物生理学会年会2020.3.19-21（大阪）

  2. 1.速水菜月、草野都、圓山恭之進、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「メタボロームおよびトランスクリプトーム解析を用いた植物の温度適応機構の解析」 第６１回日本植物生理学会年会2020.3.19-21（大阪）


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2018年度

学会発表

  1. 7.Tokizawa M, Enomoto T, Ito H, Yamamoto YY, Kobayashi Y, Kochian LV, Koyama H, “Alminum-induced protein response-like activity regulates aluminum torelance via STOP1/ALMT- and ER-resident chaperone induction pathways”, American Society of Plant Biologists Meeting, 7. 14-18, 2018, Montreal, Canada.

  2. 6.Tokizawa M, Enomoto T, Ito H, Yamamoto YY, Kobayashi Y, Kochian LV, Koyama H, “STOP1 transcription factor regulates the early aluminum-inducible expression of its primary target genes throughout unfolded protein response-like pathway”, 10th International Symposium on Plant-Soil Interaction at Low pH (PSILPH), 6. 25-28, , 2018, Malaysia

  3. 5.平塚柊星、山本義治「塩基配列情報をもとにしたプロモーター位置の推定」 第６０回日本植物生理学会年会2019.3.13-15（名古屋）

  4. 4.速水菜月、日恵野綾香、草野都、圓山恭之進、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「メタボロームおよびトランスクリプトーム解析を用いた植物の温度適応機構の解析」 第６０回日本植物生理学会年会2019.3.13-15（名古屋）

  5. 3.土屋沢実、趙成日、Smita Sahoo、Sanjib K. Panda、速水菜月、圓山恭之進、井内聖、山本義治「ABA応答を担うプロモーターの再構成実験」　第６０回日本植物生理学会年会2019.3.13-15（名古屋）

  6. 2.平塚柊星、山本義治「塩基配列をもとにしたプロモーター位置の予測法の開発」 第１回植物インフォマティクス研究会（川崎）2018.9.10 ポスター賞受賞

  7. 1.山本義治、市田裕之、日恵野綾香、小畑大地、時澤睦朋、野元美佳、多田安臣、楠和隆、小山博之、速水菜月「２因子性の転写制御配列予測法の開発」第１回植物インフォマティクス研究会（川崎）2018.9.10


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2017年度

招待講演・講習会など

  1. 3.Yamamoto YY, “Partial identification of transcriptional network for the H2O2 response in Arabidopsis”, Assam University, Silcher, India 2017.12.18.

  2. 2.Yamamoto YY, “Promoter switching in Arabidopsis and rice”, International Conference on Plant Development Biology and National Arabidopsis Meeting 2017, Bhubaneswar, India, 2017. 12.

  3. 1.山本義治「高等植物の温度適応機構」辻英夫先生米寿記念シンポジウム「植物生理学とオルガネラ研究の過去・現在・未来」2017.5.26（京都）


学会発表

  1. 7.楠和隆、時澤睦朋、牛島智一、松下智直、兼﨑友、鈴木雄二、小山博之、山本義治「シロイヌナズナとイネのプロモータースイッチの大規模同定」第５９回日本植物生理学会年会2018.3.28-30（札幌）

  2. 6.Kusunoki K, Tokizawa M, Ushijima T, Matsushita T, Kanesaki Y, Suzuki Y, Koyama H, Yamamoto YY, “Massive identification of promoter switching in Arabidopsis and rice”, Taiwan-Japan Plant BIology 2017, Taipei, Taiwan, 2017.11.3-6.

  3. 5.楠和隆、山本義治「ppdb, Plant Promoter Database」トーゴーの日シンポジウム2017（JSTバイオサイエンスデータベース事務局主催）　2017.10.4-5（東京）

  4. 4.楠和隆，山本義治 ppdb, Plant Promoter Database 日本土壌肥料学会2017年度大会2017.9.5-7（仙台）

  5. 3.楠和隆、中野友貴、田中啓介、坂田洋一、井内聖、小林正智、山本義治、小山博之、小林佑理子「シロイヌナズナ野生系統トランスクリプトーム解析によるアルミニウム耐性遺伝子のネットワーク解析」 日本土壌肥料学会2017年度大会2017.9.5-7（仙台）

  6. 2.浦和博子、山本義治、所祐子、野田千尋、高木裕太、岡田清孝、圓山恭之進「高温誘導性合成プロモーターを用いた局所的遺伝子発現誘導法のブラッシュアップ」日本植物細胞分子生物学会2017.8.29-31（大宮）

  7. 1.速水菜月、日恵野綾香、草野都、圓山恭之進、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「高密度データを用いたシロイヌナズナの温度適応機構の解析」日本光合成学会2017.5.27-28（草津）


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2016年度

招待講演・講習会など

  1. 2.Yamamoto YY, “Empirical identification of the transcriptional regulatory network for the H2O2 response in Arabidopsis”, Indo-Japan Workshop on Translational Agriculture -avenues for international cooperation, Guwahati, India, 2017. 3.29.

  2. 1.Yamamoto YY, “Empirical identification of the transcriptional regulatory network for the H2O2 response in Arabidopsis”, International Center for Genetic Engineering and Biotechnology, New Dehli, India, 2017. 3.27.


学会発表


  1. 15.伊福健太郎、閻東怡、西出浩世、山本義治、内山郁夫、菓子野康浩「実用珪藻 Chaetoceros gracilisのバイオファクトリー化に向けた基盤技術の開発」農芸化学会大会2017年度大会2017.3.17-20（京都）大会トピック賞受賞

  2. 14.清水琴恵、野元美佳、福井大和、板谷知健、森毅、時澤睦朋、山本義治、塚越啓央、多田安臣「転写補助因子SNI1とNPR1によるWRKY転写因子を介したSA応答性遺伝子発現制御機構の解析」 第５８回日本植物生理学会年会2017.3.16-18（鹿児島）

  3. 13.速水菜月、 日恵野綾香、草野都、圓山恭之進、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「メタボロームおよびトランスクリプトーム解析を用いた植物の温度適応機構の解析」 第５８回日本植物生理学会年会2017.3.16-18（鹿児島）

  4. 12.山本義治、市田裕之、日恵野綾香、小畑大地、時澤睦朋、野元美佳、多田安臣、速水菜月「トランスクリプトームデータをもとにした転写制御配列予測法の拡張」 第５８回日本植物生理学会年会2017.3.16-18（鹿児島）

  5. 11.Nomoto M, Skelly MJ, Itaya T, Tsukagoshi H, Mori T, Suzuki T, Oka N, Matsushita T, Tokizawa M, Mori H, Yamamoto YY, Higashiyama T, Spoel SH, Tada Y. “Transcriptional context switches plant immune cofactors between activator and repressor behavior” Cold Spring Harbor Asia Conference, “Latest advances in plant development & environmental response, Awaji Japan 2016.11.29-12.2.

  6. 10.Hayami N, Hieno A, Kusano M, Maruyama K, Higuchi M, Hanada K, Matsui M, Yamamoto YY. “Metabolic dynamics and transcriptional regulation in temperature adaptation of Arabidopsis” Cold Spring Harbor Asia Conference, “Latest advances in plant development & environmental response, Awaji Japan 2016.11.29-12.2.

  7. 9.時澤睦朋、楠和隆、小山博之、黒谷篤之、櫻井哲也、鈴木穣、坂本智昭、倉田哲也、山本義治「シロイヌナズナ転写開始点の網羅的な同定によるGenic/Non-genicプロモーター構造の解析とShoot/Root間のプロモータースイッチの同定」 第４５回根研究会（岡山）2016.9.30-10.1.

  8. 8.時澤睦朋、榎本拓央、藤井健生、小林佑理子、井内聖、小林正智、野元美佳、多田安臣、山本義治、小山弘之「アルミニウム耐性に関わる転写因子STOP1の根における転写制御ネットワークの解析」第４５回根研究会（岡山）2016.9.30-10.1.

  9. 7.Hamasaki H, Kurihara Y, Kuromori T, Kobayashi M, Kusano H, Imura Y, Nagata N, Shimada H, Yamamoto YY, Matsui M. “SnRK1 kinase and the NAC transcription factor SOG1 as possible components of a mitochondrial retrograde signaling pathway mediating the low energy response triggered by low ATP levels” The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Kyoto, 2016.9.10-14.

  10. 6.Hayami N, Hieno A, Kusano M, Maruyama K, Higuchi M, Hanada K, Matsui M, Yamamoto YY. “Metabolic dynamics and transcriptional regulation in temperature adaptation of Arabidopsis” The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Kyoto, 2016.9.10-14.

  11. 5.Hieno A, Naznin HA, Hasegawa-Inaba K, Yokogawa T, Obata D, Nomoto M, Tada Y, Yokogawa T, Higuchi M, Hanada K, Matui M, Hirayama T, Mitsuda N, Yamamoto YY. “Empirical identification of the transcriptional network for H2O2 responses in Arabidopsis” The 13th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Kyoto, 2016.9.10-14.

  12. 4.時澤睦朋, 榎本拓央, 藤井健生, 小林佑理子, 井内聖, 小林正智, 野元美佳, 多田安臣, 山本義治, 小山博之「シス配列予測を用いたアルミニウムストレス耐性における転写制御因子STOP1 の転写制御」日本土壌肥料学会2016年度大会（佐賀）2016.9.20-22.

  13. 3.野元美佳、板谷知健、岡和、鈴木孝征、森毅、塚越啓央、松下智直、時澤睦朋、山本義治、東山哲也、Steven Spoel、多田安臣「植物免疫系の制御因子であるNPR1とJAZが制御するERF1依存的な遺伝子発現機構の解析」日本植物学会（宜野湾市）2016.9.16-19.

  14. 2.浦和博子、山本義治、所祐子、高木裕太、圓山恭之進、岡田清孝「高温誘導性合成プロモーターを用いたシロイヌナズナにおける局所的遺伝子発現誘導」日本植物学会大会沖縄県宜野湾市2016.9.16-19.

  15. 1.Ogita N, Tokiawa M, Yamamoto YY, Okushima Y, Kurata T, Okamoto-Yoshiyama K, Hiruma K, Saijo Y, Takahashi N, Umeda M “Comprehensive analysis of target genes of SOG1, a master regulator of DNA damage response” Plant Genome Stability and Change 2016, Hayama, Japan, 2016.7.7-10.



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2015年度

招待講演・講習会など

  1. 8.Yamamoto YYm Kusunoki K, Tokizawa M, Hieno A, ‘ppdb: Plant Promoter Database”, The 1st GU-NAST International Joint Meeting (GU-NAST 2015) “Developing New Research Excellence in Natural Science and Technology”, Gifu, 2015.12.10-11.

  2. 7.Yamamoto YY, “Prediction-oriented promoter analysis to study environmental response of higher plants”, National Institute of Technology, Durgapur, India, 2015.9.23.

  3. 6.Yamamoto YY, “Prediction-oriented promoter analysis to study environmental response of higher plants”, Visva-Bharati University, Santiniketan, India, 2015.9.22.

  4. 5.Yamamoto YY, “Prediction-oriented promoter analysis to study environmental response of higher plants”, Bose Institute, Kolkata, India, 2015.9.21.

  5. 4. Yamamoto YY, “Semidry Analysis of plant promoters”, Indian Institute of Technology Guwahati, Guwahat, India, 2015.9.17

  6. 3.野元美佳、塚越啓央、森毅、鈴木孝征、Michael Skelly、岡和、松下智直、時澤睦朋、山本義治、東山哲也、Steven Spoel、多田安臣「植物免疫系が制御するグローバルネットワークの解析」日本植物学会シンポジウム「植物の環境認識と自立分散型情報統御システム」新潟2015.9.6

2. 山本義治「強光・低温ストレスと植物の転写応答」九州大学　2015.6.24

1. 山本義治「強光・低温ストレスと植物の転写応答」筑波大学フードセキュリティーセミナー　2015.5.28



学会発表

  1. 17. 伊藤 弘樹，小林 佑理子，時澤 睦朋，多田 安臣，山本 義治，小山 博之「タバコのアルミニウムおよび低pH 耐性転写因子NtSTOP1 転写制御機構に関する研究」 日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  2. 16.濱崎 英史，栗原 志夫，黒森 崇，小林 恵，井村 優子，永田 典子，島田 浩章，山本 義治，松井 南 ”Signaling pathway involving SOG1 and SnRK1 controls Arabidopsis development via mitochondrial ATP” 日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  3. 15.圓山恭之進、，小賀田 拓也，金森 紀仁，篠崎 和子，後藤 新悟，山本 義治，井内 聖，浦野 薫，櫻井 哲也，小嶋 美紀子，榊原 均，篠崎 一雄　「高温誘導性プロモーターをデザインする」 日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  4. 14.野元美佳、塚越啓央、森毅、鈴木孝征、Michael Skelly、岡和、松下智直、時澤睦朋、山本義治、東山哲也、Steven Spoel、多田安臣「サリチル酸／ジャスモン酸シグナルを制御するNPR1とJAZが介在する転写制御ネットワークの解析」 日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  5. 13.日恵野綾香、 フシュナ・アラ・ナズニン、花田耕介、樋口美栄子、松井南、山本義治「シロイヌナズナの過酸化水素応答のトランスクリプトーム解析」日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  6. 12.日恵野綾香、フシュナ・アラ・ナズニン、長谷川桂子、横川朋子、小畑大地、横川隆志、野元美佳、多田安臣、山本義治「過酸化水素応答を担う転写因子間の発現制御ネットワークの実験的同定」 日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  7. 11.速水菜月、日恵野綾香、草野都、圓山恭之進、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「シロイヌナズナの温度適応における代謝変動と転写制御」日本植物生理学会（盛岡）2016.3.18-20.

  8. 10. Tokizawa M, Enomoto T, Kobayashi Y, Tada Y, Yamamoto YY, Koyama H  “Transcriptional regulation of Aluminum tolerance genes by STOP1 transcription factor in Arabidopsis thaliana”   The 9th International Symposium on Plant-Soil Interactions at Low pH, Dubrovnik, Croatia, 2015.10.18-23.　

  9. 9.時澤睦朋、榎本拓央、小林佑理子、野元美佳、多田安臣、山本義治、小山博之　「シロイヌナズナ転写制御因子STOP1によるアルミニウム耐性遺伝子の転写制御機構の解析」 日本土壌肥料学会（京都）2015.9.9-11.

  10. 8.栗原志夫、蒔田由布子、川島美香、山本義治、松井南「bZIP型転写因子群の結合するゲノム領域の網羅的な特定」日本植物学会、新潟、2015.9.6

  11. 7.森毅、時澤睦朋、西岡愛実、山下隼、山本義治、塚越啓央、多田安臣「植物免疫系の活性化による生長制御機構の解析」 日本植物学会、新潟、2015.9.7

  12. 6.野元美佳、塚越啓央、森毅、鈴木孝征、Michael Skelly、岡和、松下智直、時澤睦朋、山本義治、東山哲也、Steven Spoel、多田安臣「サリチル酸／ジャスモン酸シグナルを制御するNPR1とJAZが介在する転写制御ネットワークの解析」新潟2015.9.7-8

  13. 5.Nakano Y, Kusunoki K, Iuchi S, Tokizawa M, Yamamoto YY, Kobayashi M, Kobayashi Y, Koyama H, “Adaptive strategies of Arabidopsis thaliana to acid soil environment.” The 4th UGSAS-GU International Symposium, Gifu,  2015.8.27. Poster Award

  14. 4.Hayami N, Sakai Y, Saito T, Kimura M, Tokizawa M, Nomoto M, Tada Y,  Iuchi S, Yamamoto YY, “Prediction-oriented promoter analysis of Arabidopsis ELIP2 revealed novel transcriptional regulatory elements that unite UV-B, high light and cold stress response.” The 4th UGSAS-GU International Symposium, Gifu,  2015.8.27.

  15. 3.Ogita N, Okushima Y, Kurata T, Tokizawa M, Yamamoto YY, Takahashi N, Umeda M, “ Analysis of direct target genes of SOG1, a key transcription factor involved in DNA damage response.”  International Congress on Arabidopsis Research (ICAR2015) Paris 2015.7.5-9.

  16. 2.M. Nomoto1, H. Tsukagoshi2, T. Mori1, T. Suzuki3, M.J. Skelly4, T. Matsushita5, Y.Y. Yamamoto6, T. Higashiyama7 , S.H. Spoel4, Y. Tada, “Reciprocal regulation between salicylate- and jasmonate-responsive transcription factors in plant immunity”, International Congress on Arabidopsis Research (ICAR2015) Paris 2015.7.5-9.

  17. 1.M. Nomoto, H. Tsukagoshi, T. Mori, T. Suzuki, M.J. Skelly, N. Oka, T. Matsushita, M. Tokizawa, Y.Y. Yamamoto, T. Higashiyama, S.H. Spoel, Y. Tada “Reciprocal regulation between salicylate- and jasmonate-responsive transcription factors in plant immunity” International ERATO Higashiyama Live-Holonics Symposium and Technical Workshop 2015 "Organogenesis from Eggs to Mature Plants" Nagoya, 2015.5.1.


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2014年度

招待講演・講習会など

  1. 5.多田安臣、野元美佳、塚越啓央、岡和、鈴木孝征、松下智直、時澤睦朋、山本義治、東山哲也、Spoel Steven “Immune co-factor NPR1 regulates reciprocal interaction between salicylic acid and jasmonic acid-mediated signal pathways” 日本植物分子生物学会シンポジウム “Learning plant physiology on plant-pathogen interactions” 2014.3.16-18 （東京）

  2. 4.多田安臣、野元美佳、岡和、Mohan Rajinkikanth、塚越啓央、時澤睦朋、大西優太郎、山本義治、Dong Xinnian、Spoel Steven　「レドックス感受性転写補助因子であるNPR1が制御するサリチル酸依存的植物免疫機構」 日本遺伝学会ワークショップ「植物レドックス研究最近のトピック」（長浜）2014.9.19　（世話人：山本義治、多田安臣）

  3. 3.山本義治「シロイヌナズナの光防御応答を活性化する環境ストレス」日本遺伝学会ワークショップ「植物レドックス研究最近のトピック」（長浜）2014.9.19　（世話人：山本義治、多田安臣）

2. 山本義治「転写ネットワーク解明のための植物プロモーター解析」北海道大学大学院理学研究科 2014.6.5

  1. 1.山本義治「転写ネットワーク解明のための植物プロモーター解析」奈良先端大学院大学バイオサイエンス研究科 2014.5.29



学会発表

  1. 23.Kamara M, Kobayashi Y, Sakran R, Kobayashi Y, Yamamoto YY, Koyama H, “Transcriptome analysis of combined stress responses between drought and high salinity in maize”, 日本育種学会第１２７回講演会　東京　2015. 3. 21

  2. 22.森毅, 野元美佳, 時澤睦朋, 山下隼, 山本義治, 塚越啓央, 多田安臣 「疾病防御応答の活性化による生長制御機構の解明」日本植物病理学会（東京）2015.3.28-31. 学生優秀発表賞受賞

  3. 21.Natsuki Hayami, Tatsunori Saito, Mutsutomo Tokizawa, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Yoshiharu Y. Yamamoto, “Prediction-Oriented Promoter Analysis of Arabidopsis ELIP2, a Stress-Activated Member of the LHC Superfamily, Revealed a Novel Transcriptional Regulatory Elements that Unites High Light, UV-B and Cold Stress Responses”, 2nd CRL International Forum ‘Tokyo Tech-HHU Düsseldorf Joint Symposium on Photosynthesis as a New Chemical Resource’, Tokyo, 2015.

  4. 20.Tokizawa M, Kobayashi Y, Saito T, Iuchi S, Kobayashi M, Nomoto M, Tada Y, Yamamoto YY, Koyama H, “Analysis of regulation of  ALMT1 expression in response to Aluminum stress”, The 2nd International Symposium on Plant Environmental Sensing, (Tokyo) 2015.3.13-15.

  5. 19. Hieno A, Naznin MHA, Hyakumachi M, Sawaki K, Koyama H, Higuchi M, Hanada K, Matsui M, Tokizawa M, Yamamoto YY, “Microarray analysis of H2O2 responses and in silico prediction of the transcriptional regulatory elements”, The 2nd International Symposium on Plant Environmental Sensing, (Tokyo) 2015.3.13-15.

  6. 18.中野 友貴，大橋 聖，楠 和隆，井内 聖，時澤 睦朋，山本 義治，小林 正智，小山 博之，小林 佑理子「ゲノムワイド関連解析によるシロイヌナズナアクセッション間のAl 耐性に関与する遺伝的変異の同定」 日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  7. 17.栗原 志夫，蒔田 由布子，川島 美香，山本 義治，松井 南 “Next-generation Sequencing Of Genomic DNA Fragments Bound To HY5 Transcription Factor in vitro” 日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  8. 16.荻田 伸夫，奥島 葉子，倉田 哲也，時澤 睦朋，山本 義治，高橋 直紀，梅田 正明「DNA 損傷応答に関わる転写因子SOG1 の標的遺伝子の解析」 日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  9. 15.圓山恭之進、後藤新悟、光田展隆、石塚徹、瀧口裕子、市川裕章、山本義治、井内聖、浦野薫、篠崎一雄「乾燥環境下におけるダイズ・イネ・トウモロコシの転写経路」日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  10. 14.内藤彩乃、 中野友貴、 齋藤竜典、小山博之、小林佑理子、山本義治「シロイヌナズナ光防御関連遺伝子ELIP2の発現量ナチュラルバリエーションを利用したeGWASの試み」 日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  11. 13.速水菜月、日恵野綾香、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治　「強光・低温の複合ストレス応答を用いた環境ストレス応答性遺伝子群の分類」 日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  12. 12.齋藤竜典、速水菜月、野元美佳、多田安臣、松井南、光田展隆、山本義治　「光防御関連遺伝子ELIP2のプロモーターに結合する転写因子のin vitroスクリーニング」　日本植物生理学会（東京）2015.3.16-18

  13. 11.時澤睦朋 「ゲノムワイドな転写開始点解析によるプロモータースイッチの網羅的解析」植物科学グローバルトップ教育推進プログラム主催 平成26年度 成果報告会（奈良）2015.2.24-25.

  14. 10.野元美佳、Rajinikanth Mohan、塚越啓央、岡和、時澤睦朋、山本義治、Xinnian Dong、多田安臣　「植物免疫応答を制御する新奇NPR1結合因子の同定」 日本分子生物学会（横浜）2014.11.25-27

  15. 9.齋藤竜典、 時澤睦朋、 日恵野綾香、 松井南、 光田展隆、 野元美佳、多田安臣、山本義治「in vitro DNA-タンパク質結合アッセイによるシロイヌナズナのプロモーター結合タンパク質の同定」 日本分子生物学会（横浜）2014.11.25-27

  16. 8.内藤 彩乃、中野 友貴、 小山 博之、小林 佑理子、 石野 はるか、 山本 義治「シロイヌナズナの光合成活性を利用した強光、低温ストレス耐性のナチュラルバリエーションの評価」日本分子生物学会（横浜）2014.11.25-27

  17. 7.Yamamoto YY, Hayami N, Tokizawa M, Hieno A, Zhao C-R, Saito T, Iuchi S, Kobayashi M “Prediction-oriented plant promoter analysis”, The 38th Naito Conference  on “Molecule-based biological systems”, (Sapporo) 2014.10. 7-10.

  18. 6.中野友貴、大橋聖、楠正隆、時澤睦朋、山本義治、井内聖、小林正智、小山博之、小林佑理子「シロイヌナズナにおけるアルミニウム及び低pH耐性のゲノムワイド関連解析」 日本土壌肥料学会（東京）2014.9.9-11 ポスター賞受賞

  19. 5.時澤睦朋、小林佑理子、齋藤竜典、井内聖、小林正智、野元美佳、多田安臣、山本義治、小山博之「シロイヌナズナリンゴ酸トランスポーターALMT1遺伝子の複雑な転写制御機構の解析」日本土壌肥料学会（東京）2014.9.9-11

  20. 4.速水菜月、石野はるか、日恵野綾香、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「シロイヌナズナを用いた強光・低温ストレス応答の関連解析」 日本光合成学会（奈良）2014.5.30-31

  21. 3.内藤 彩乃、石野 はるか、大橋 聖、中野 友貴、小山 博之、小林 佑理子、山本 義治「シロイヌナズナの光合成活性を指標とした強光、低温ストレス耐性のナチュラルバリエーション」日本光合成学会（奈良）2014.5.30-31

  22. 2.速水菜月、日恵野綾香、Naznin Most. Hshuna Ara、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、山本義治「バイオインフォマティクスに基づく植 物プロモーター解析」 日本植物病理学会（札幌）2014.6.2

  23. 1. 日恵野綾香、Naznin Most. Hushna Ara、百町満朗、澤木克亘、小山博之、樋口美栄子、花田耕介、松井南、山本義治「過酸化水素応答を担う転写制御配列の予測と転写ネットワーク解析」日本植物病理学会（札幌）2014.6.2


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2013年度


招待講演・講習会など

  1. 4.Yamamoto YY, “Semidry analysis of plant promoters”  (MTA Centre for Agricultural Research, Hungarian Academy of Sciences, Martonvásár, Hungary) 2013.10.28

  2. 3.Yamamoto YY, “Semidry analysis of plant promoters”  (Helmholtz Association of German Research Centres, Juellich, Germany) 2013.10.15

  3. 2.山本義治「シロイヌナズナの強光ストレス応答の解析」（東北大学）2013.7.25

  4. 1.山本義治「シロイヌナズナの強光ストレス応答の解析」（岩手大学）2013.7.24



学会発表

  1. 22. 中野友貴、大橋聖、山中啓史、井内聖、小林正智、山本義治、小山博之、小林佑理子「シロイヌナズナにおけるアルミニウム及び低pH耐性のゲノムワイド関連解析」 日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  2. 21.圓山恭之進、後藤新悟、中島一雄、山本義治、櫻井哲也「乾燥環境下における単子葉植物（イネ・トウモロコシ）特異的シス因子の同定」 日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  3. 20.三田村梨帆、野元美佳、森毅、時澤睦朋、山本義治、多田安臣「JAZ-MYCモジュールを介したNO初期認識機構の解明」 日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  4. 19.野元美佳、森毅、Rajinikanth Mohan、岡和、時澤睦朋、秋光和也、山本義治、Xinnian Dong、多田安臣「サリチル酸シグナルにおける新奇NPR1相互作用因子の機能解析」日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  5. 18.時澤睦朋、小林安文、小林佑理子、井内聖、小林正智、野元美佳、多田安臣、山本義治、小山博之「シロイヌナズナリンゴ酸トランスポーターALMT1遺伝子のアルミニウム応答の解析」 日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  6. 17.日恵野綾香、Most. Hushna Naznin、百町満朗、澤木克亘、小山博之、樋口美栄子、花田耕介、松井南、時澤睦朋、趙成日、山本義治「過酸化水素に対する転写応答のマイクロアレイ解析と転写制御配列のin silico予測」 日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  7. 16.速水 菜月、石野はるか、内藤彩乃、日恵野綾香、樋口美栄子、花田耕介、松井 南、山本義治「シロイヌナズナにおける強光・低温ストレス応答の関連解析」 日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  8. 15.内藤彩乃、石野はるか 、大橋聖 、中野友貴、小林佑理子、小山博之、山本義治「光合成活性を指標とした強光、低温ストレス耐性のナチュラルバリエーション」日本植物生理学会（富山）2014.3.18-20

  9. 14.佐藤壮一郎、松尾充啓、松崎素道、山本義治、小保方潤一「ATG開始コドン欠損型の偽遺伝子化はゲノム上で転写領域の消失を引き起こす」日本分子生物学会（神戸）2013.12.3-6

  10. 13.Mori T, Nomoto M, Tokizawa M, Akimitsu K, Yamamoto YY, Tada Y. “Prediction of the core cis-regulatory elements responsible for salicylic acid-dependent gene expression. 香川大学農学部主催「ファイトジーンの可能性と未来VI（国際学会）」（高松）2013.10.28

  11. 12.Mitamura R, Nomoto M, Tokizawa M, Akimitsu K, Yamamoto YY, Tada Y. “ Nitric oxide activates JAZ-mediated signaling pathway in Arabidopsis”, 香川大学農学部主催「ファイトジーンの可能性と未来VI（国際学会）」（高松）2013.10.28

  12. 11.三田村梨帆、野元美佳、森毅、時澤睦朋、秋光和也、山本義治、多田安臣　「一酸化窒素が活性化するジャスモン酸シグナル伝達機構の解明」日本植物病理学会関西支部会（岡山）2013. 9. 26-27

  13. 10.江隈美鈴、小林佑理子、小林安文、山本義治、井内聖、小林正智、小山博之「シロイヌナズナエコタイプを用いた銅過剰と鉄欠乏クロロシスの関係解析」 日本土壌肥料学会（名古屋）2013. 9. 11-13

  14. 9.大橋聖、中野友貴、小林佑理子、山本義治、井内聖、小林正智、小山博之「シロイヌナズナのアルミ耐性のナチュラルバリエーション」 日本土壌肥料学会（名古屋）2013.9.11-13

  15. 8.時澤睦朋、小林安文、小林佑理子、山本義治、小山博之「アルミニウム応答性リンゴ酸トランスポーターALMT1遺伝子の転写制御機構の解析」日本土壌肥料学会（名古屋）2013.9.11-13    ポスター賞受賞

  16. 7.時澤睦朋、櫻井哲也、黒谷篤之、篠崎一雄、山中啓史、小山博之、鈴木穣、菅野純夫、小保方潤一、山本義治「次世代シークエンサーを用いたシロイヌナズナの転写開始点位置の大規模同定」第三回NGS現場の会（神戸）2013.9.4-5

  17. 6.森毅、野元美佳、時澤睦朋、山本義治、多田安臣「サリチル酸シグナル伝達におけるNPR1応答性シスエレメントの同定」感染生理談話会（北陸粟津温泉）2013.8.19-21

  18. 5.三田村梨帆、 野元美佳、 森毅、時澤睦朋、山本義治、多田安臣「植物免疫応答における一酸化窒素応答性因子の同定」感染生理談話会（北陸粟津温泉）2013.8.19-21 　ポスター賞受賞

  19. 4.大出奈穂子、遊佐陽一、山本義治、永田典子「嚢舌亜目ウミウシの葉緑体取り込みメカニズムに関する超微構造学的解析」日本植物学会（北海道大学）2013.9.13-15

  20. 3.佐藤優太、松山明加、山本義治、早川享志、中川智行「出芽酵母の遺伝子プロモータにおけるアセトアルデヒド特異的応答配列の探索とMet4依存的硫黄代謝系の機能」日本生物工学会年会（広島）2013.9.18-20

  21. 2.速水菜月、坂井優作、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、井内聖、小林正智、齋藤竜典、小林佑理子、小山博之、山本義治「光防御関連遺伝子ELIP2プロモーターに含まれる、強光、UV-B、低温ストレス応答を統合する制御配列」日本光合成学会年会（名古屋大学）2013.5.31-6.1　ポスター賞受賞

  22. 1.石野はるか、内藤彩乃、大橋聖、小山博之、小林佑理子、山本義治「強光・低温ストレス耐性におけるシロイヌナズナナチュラルバリエーションの解析」日本光合成学会年会（名古屋大学）2013.5.31-6.1



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2012年度


招待講演・講習会など

9. 山本義治「光合成生物の歴史」岐阜大学フィールド科学センター市民講座 2012.12.16

8. 山本義治「植物プロモーター学」集中講義　京都大学大学院理学研究科植物学教室 2012.11.28-9

7. 山本義治　「植物プロモーターのセミドライ解析」京都大学理セミナー 2012.11.28

  1. 6.Yoshiharu Y. Yamamoto, “Arabidopsis Promoter Analysis” Congress of International Plant Biology (ISPMB), Evening Seminar (Jeju, South Korea)  2012.10.23

  2. 5.Yoshiharu Y. Yamamoto, “Plant Promoter Analysis in the Genomic Age” Symposium on Plant Biology and Agrobiotechnology, in honor of Prof. Xing-Wang Den’s 50th Birthday (Beijing) 2012.10.17-18

  3. 4.山本義治　「植物転写ネットワークの理解のためのプロモーター解析」JSBiアグリバイオインフォマティクス研究会「モチーフ解析最前線」（東京）2012.10.3

  4. 3.山本義治　第５６回全国農業実験実習講習会（農業高校の先生向け）「植物の環境応答：フィトクロムとフォトトロピン」（岐阜）2012.8.10

  5. 2.山本義治　生物資源研セミナー「ゲノム時代の植物プロモーター解析」（筑波）2012.7.31

1. 新学術・植物環境感覚班会議（盛岡）2012.6.15-17



学会発表

  1. 13.佐藤壮一郎,  松尾充啓,  山本義治,  小保方潤一　「遺伝子重複型偽遺伝子の転写状態の維持におけるATG配列の役割」 日本植物生理学会（岡山）2013.3.21

  2. 12.山中啓史, A. Hoekenga　Owen, Lipka Alex, Gore Michael,  山本義治,  小山博之,  小林佑理子 「シロイヌナズナのアルミニウム耐性のゲノムワイド関連解析」日本植物生理学会（岡山）2013.3.21

  3. 11.日恵野綾香・時澤睦朋・小山博之・小保方潤一・山本義治「植物プロモーターデータベースppdb ver3.0の紹介」日本植物生理学会（岡山）2013.3.21

  4. 10.坂井優作、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林祐理子、小山博之、井内聖、小林正智、速水菜月、齋藤竜典、山本義治「強光・紫外線・低温ストレス及び概日リズムに応答するELIP2のプロモーター解析」日本植物生理学会（岡山）2013.3.21

  5. 9.大出奈穂子、遊佐陽一、山本義治、永田典子「嚢舌亜目ウミウシの盗葉緑体メカニズムの超微構造学的解析」第３７回日本顕微鏡学会関東支部講演会（東京）2013.3.6

  6. 8.Naznin HA, Yoshioka Y, Hieno A, Yamamoto YY, Hyakumachi M “In silico analysis of transcriptional regulatory elements related with disease resistance” 日本植物病理学会関西支部会（鳥取）2012.9.27

  7. 7.山中啓史、 Hoekenga Owen,、Likpa Alex、Gore Michael、山本義治、小山博之、小林佑理子　「シロイヌナズナにおけるアルミニウム耐性のゲノムワイド相関解析」 日本土壌肥料学会（鳥取）2012.9

  8. 6.時澤睦朋、趙成日、 澤木宣忠、小林安文、小林佑理子、小山博之、吉岡洋平、百町満朗、山本義治　「マイクロアレイデータを用いた金属イオン応答に関わる転写制御配列の解析」日本土壌肥料学会（鳥取）2012.9

  9. 5.吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、趙成日、坂井優作、山本義治　「合成プロモーターを利用した転写ネットワーク解析の試み」日本土壌肥料学会（鳥取）2012.9

  10. 4.Hushna Ara Naznin, Yohei Yoshioka, Ayaka Hieno, Mitsuro Hyakumachi, and Yoshiharu Y.Yamamoto, “In silico analysis of transcriptional regulatory elements related with disease resistance”. XV International Congress of Molecular Plant-Microbe Interactions, July 29- Aug 2, Kyoto

  11. 3.Yohei Yoshioka “Prediction of transcriptional regulatory elements for systemic resistance induced by a plant growth promoting gungus Penicillium simplicissimum GP17-2 based on microarray data” IOBC/WPRS Working Group “Biocontrol of Plant Pathogens in Sustainable Agriculture”, 2012. July 24-27, Reims, France.

  12. 2.Ayaka Hieno, Naznin Most. Hushna Ara, Yohei Yoshioka, Mitsuro Hyakumachi, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Nobutaka Mitsuda, Masaru Ohme-Takagi, Yoshiharu Y. Yamamoto, “In silico prediction of transcriptional regulatory elements for stomatal regulation in disease resistance induced by plant growth promoting fungi”, 77th CSHL Symposium: The Biology of Plants 2012, Cold Spring Harbor Laboratory, USA. 2012, Jun

  13. 1.Yohei Yoshioka, Mitsuro Hyakucachi, Yuriko Kobayashi,Hiroyuki Koyama, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Tetsuya Sakurai, Kazuo Shinozaki, Nobutaka Mitsuda, Masaru Ohme-Takagi, Yasuomi Tada, Yoshiharu Y. Yamamoto, “Plant promoter analysis in the genomic age”, 77th CSHL Symposium: The Biology of Plants 2012, Cold Spring Harbor Laboratory, USA. 2012, June


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2011年度


招待講演・講習会など

  1. 8.Yamamoto YY “Understanding plant promoters” Lunch Time Seminar, Alberta Innovates - Technology Futures, Vegreville, Alberta, Canada. 2011.10.4.

  2. 7.山本義治「植物プロモーターをデコードする」日本遺伝学会ワークショップ「植物ゲノム研究の最近のトピック」（京都）2011.9.20

  3. 6.山本義治「ゲノム時代のプロモーター解析」日本植物細胞分子生物学会シンポジウム「植物の逆遺伝学的解析技術はどこまで来たか」（福岡）2011.9.7

5. 「植物の環境応答：フィトクロムとフォトトロピン」岐阜県高等学校生物部会研究大会（岐阜）2011.8.18

4.「ざっとみた光合成生物の歴史」 岐阜大オープンキャンパス模擬講義（岐阜）2011.8-8, 9.

3. 新学術・植物環境感覚班会議（岡崎）2011.6.25-7

2. 山本義治「植物プロモーターの構造を理解するために」東京農大バイオサイエンスセミナー（東京）2011.5.26

  1. 1. 山本義治「シロイヌナズナのTSS解析」遺伝研研究会「次世代シーケンシング時代の分子進化研究」（三島）2011.4.27



学会発表

  1. 20.Mutsutomo Tokizawa, Hirofumi Yamanaka, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Tetsuya Sakurai, Atushi Kurotani, Kazuo Shinozaki, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Junichi Obokata, Yoshiharu Y. Yamamoto. “Large-scale analysis of transcription start sites of Arabidopsis thaliana by next generation sequencer” 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing. （奈良） 2012年3月

  2. 19.Yohei Yoshioka, Ayaka Hieno, Naznin Hushna Ara, Mitsuro Hyakumachi, Mutsutomo Tokizawa, Yuriko Kobayashi, Hiroyuki Koyama, Satoshi Iuchi, Masatomo Kobayashi, Kyonoshin Maruyama, Kazuko Yamaguchi-Shinozaki, Yusaku Sakai, Cheng-Ri Zhao, Yoshiharu Y. Yamamoto. “Prediction of transcriptional regulatory elements for response to environmental stress” 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing. （奈良） 2012年3月

  3. 18.Ayaka Hieno, Naoki Sato, Daniel Lang, Stefan Rensing, Tomoaki Nishiyama, Mitsuyasu Hasebe, Junichi Obokata, Yoshiharu Yamamoto Y. “ppdb, Plant Promoter Database” 1st International Symposium on Plant Environmental Sensing. （奈良） 2012年3月

  4. 17.吉岡洋平、日恵野綾香、Most. Hushna Ara Naznin、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、圓山恭之進、篠崎和子、坂井優作、趙成日、山本義治　「マイクロアレイデータに基づいた植物生育促進菌類Penicillium simplicissimum GP17-2株によって誘導される植物の全身的抵抗性に関する転写制御配列の予測」日本植物病理学会年会（福岡）2012年3月

  5. 16.趙成日、時澤睦朋、澤木宣忠、小林安文、小林佑理子、小山博之、吉岡洋平、百町満朗、山本義治　「マイクロアレイデータをもとにした金属イオンストレス応答を担う転写制御配列の予測」日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  6. 15.日恵野綾香、Most. Hushna Ara Naznin、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、光田展隆、高木優、坂井優作、趙成日、山本義治　「有用微生物による病害抵抗性誘導時の気孔開度を制御する転写制御配列のin silico予測」 日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  7. 14.佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一　「遺伝子重複領域内のATG開始コドンが転写状態に与える影響について」　日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  8. 13. 松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、安井孝彰、中邨真之、木村宏、山本義治、小保方潤一　「高等植物において遺伝子コード領域の存在は転写型ジーンサイレンシングを抑制する」 日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  9. 12.吉岡洋平、日恵野綾香、Most. Hushna Ara Naznin、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、圓山恭之進、篠崎和子、坂井優作、趙成日、山本義治　「マイクロアレイデータに基づいた有用微生物によって誘導される植物の全身的抵抗性に関する転写制御配列の予測」日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  10. 11.時澤睦朋、山中啓史、小林佑理子、小山博之、櫻井哲也、黒谷篤之、篠崎一雄、鈴木穣、菅野純夫、小保方潤一、山本義治　「次世代シークエンサーを用いたシロイヌナズナの転写開始位置のゲノムワイドな解析」日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  11. 10.坂井優作、吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小林佑理子、小山博之、井内聖、小林正智、石野はるか、山本義治　「転写制御配列予測を用いた光ストレス応答性遺伝子ELIP2のプロモーター解析」日本植物生理学会年会（京都）2012年3月

  12. 9.佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一　「遺伝子重複領域内のATG開始コドンの保存性が転写状態の持続性に及ぼす影響について」日本分子生物学会（横浜）2011年12月

  13. 8.櫻井哲也、黒谷篤之、鈴木穣、菅野純夫、小保方潤一、時澤睦朋、山中啓史、小林佑理子、小山博之、山本義治　「超並列型Illumina DNAシークエンサーを用いたシロイヌナズナ転写開始点の大規模解析」日本分子生物学会（横浜）2011年12月

  14. 7.吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、日恵野綾香、百町満朗、山本義治　「植物生育促進菌類Penicillium simplicissimum GP17-2株によって誘導される植物の全身的抵抗性に関するトランスクリプトーム解析」日本分子生物学会（横浜）2011年12月

  15. 6.吉岡洋平、久野修平、清水将文、百町満朗　「移動型土壌病原菌を繰り返し接種した土壌に集積する微生物相の解析」土壌微生物学会大会（宮城）2011年11月

  16. 5.吉岡洋平 「植物の全身的抵抗性誘導に関わる遺伝子のプロモーター解析」 新学術領域 植物環境感覚 若手の会（非公開）（滋賀） 2011年10月.

  17. 4.久野修平、吉岡洋平、清水将文、百町満朗　「Rhizoctona solani、Sclerotium rolfsiiおよび非病原性２核Rhizoctoniaの繰返し接種に伴うTrichoderma spp.の選択的集積と発病抑止性との関連」日本病理学会関西支部会（高松）2011.10.1

  18. 3.佐藤壮一郎、松尾充啓、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一　「植物ゲノム上でのプロモーター機能領域の出現に対するATG開始コドンの役割」日本植物学会（東京）2011年9月

  19. 2.松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一　「植物の核ゲノムにはATG開始コドンを介したプロモーター機能領域の出現メカニズムがある」日本遺伝学会（京都）2011年9月

  20. 1.時澤睦朋、Radhouane Chaffai、趙成日、山本義治、小山博之　「マイクロアレイデータを用いたイオンストレス転写制御配列予測」日本土壌肥料学会（筑波）2011.8.8~10


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2010年度



招待講演・講習会など

  1. 4. 山本義治　「マイクロアレイデータによるシス配列予測」　植物生理学会サテライトワークショップ「植物バイオインフォマティクス講習会」（仙台）2011.3.19

  2. 3.Yoshiharu Y. Yamamoto. “Differentiation of promoter architecture between plants and animals”,  International Symposium on Biodiversity Sciences , “Genome, Evolution and Environment” （ COP10 satellite symposium, 名古屋）2010.8.2

  3. 2. 山本義治「光合成をするウミウシ〜盗葉緑体と葉緑体ゲノム」日本動物学会中部支部会シンポジウム「生物の多様性を生み出す多様なしくみ」（岐阜）2010.7.24

1.  山本義治「植物プロモーターデータベースppdbの開発」名大・情報　2010.7.6



学会発表

  1. 12.吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小山博之、圓山恭之進、篠崎和子、山本義治「大規模遺伝子発現情報による植物ホルモン応答を担うシス転写制御配列の予測」日本植物病理学会（東京）2011年3月

  2. 11.吉岡洋平 、Naznin Hushna Ara、山本義治、百町満朗「有用微生物によって全身的抵抗性が誘導されたシロイヌナズナの初期応答に関するマイクロアレイ解析」日本植物病理学会（東京）2011年3月

  3. 10.工藤久幸、松尾充啓、佐藤壮一郎、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一「植物の核ゲノムにはATG開始コドンを介した新規プロモーターの新生メカニズムがある」日本植物生理学会（仙台）2011年3月

  4. 9.吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小山博之、圓山恭之進、篠崎和子、山本義治「マイクロアレイデータを用いた植物ホルモン応答を担うシス転写制御配列の予測」 日本植物生理学会（仙台）2011年3月

  5. 8.櫻井哲也、黒谷篤之、篠崎一雄、鈴木穣、菅野純夫、小保方潤一、時澤睦朋、小山博之、山本義治「Illuminaシークエンサーをもちいたシロイヌナズナオルターナティブプロモーターの探索」日本植物生理学会（仙台）2011年3月

  6. 7.松尾充啓、佐藤壮一郎、工藤久幸、中邨真之、山本義治、小保方潤一「構造遺伝子の挿入によるクリプティックプロモーターの活性化機構の解明」 日本分子生物会（神戸）2010.12.9

  7. 6.吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小山博之、山本義治「マイクロアレイデータによる植物ホルモン応答に関わる転写制御配列の推定」日本分子生物会（神戸）2010.12.7

  8. 5.吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、日恵野綾香、坂井優作、山本義治、百町満朗「シロイヌナズナの有用微生物応答に関するトランスクリプトーム解析」日本植物病理学会関西支部会（福井）2010.10.1

  9. 4.小保方潤一、工藤久幸、松尾充啓、佐藤壮一郎、中邨真之、山本義治、木村宏「クリプティックプロモーターの活性化メカニズムと転写領域の新生」 日本遺伝学会（札幌）2010.9.21

  10. 3.吉岡洋平、百町満朗、時澤睦朋、小山博之、山本義治「マイクロアレイデータを用いた植物ホルモン応答を担う転写制御配列の推定」日本遺伝学会（札幌）2010.9.21

  11. 2.工藤久幸、松尾充啓、佐藤壮一郎、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一「植物核に挿入されたコード領域配列はクロマチンのリモデリングと転写領域の新生を引き起こす」日本植物学会（春日井）2010.9.10

  12. 1.Naznin Hushna Ara, Yohei Yoshioka, Mitsuro Hyakumachi, Yoshiharu Y. Yamamoto. “Prediction of cis-regulatory elements in the promoters of genes related with disease resistance”　日本植物病理学会年会（京都）2010.4.19



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2009年度

招待講演・講習会など

4.  山本義治　「遺伝子発現データと発現制御配列：予測システムの構築」比較ゲノム情報研究会（福岡）2010.1.29

  1. 3. 山本義治　「植物プロモーターの構造」名古屋市立大学（名古屋） 2009.7.31

2.  山本義治　「構造から見たシロイヌナズナプロモーターの多様性」王子製紙森林総合研究所（亀山） 2009.6.12

  1. 1. 山本義治　「マイクロアレイデータからプロモーター解析へ」ゲノム特定領域横断植物研究会（岡崎基生研）2009.8.5



学会発表

  1. 11.工藤久幸、松尾充啓、木村宏、中邨真之、山本義治、小保方潤一「植物核に挿入されたコード領域はヌクレオソームと転写単位の再編成を引き起こす」 日本植物生理学会年会（熊本）2010.3.18~19

  2. 10.藤原誠、関根康介、山本義治、阿部知子、佐藤直樹、伊藤竜一　「シロイヌナズナMinE過剰発現体及び変異体における葉緑体FtsZ1-GFPタンパク質のライブ観察」 日本植物生理学会年会（熊本）2010.3.20

  3. 9.吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、百町満朗、山本義治　「シロイヌナズナの全身的抵抗性誘導に関するマイクロアレイ解析」日本植物生理学会年会（熊本）2010.3.20

  4. 8.山本義治　「マイクロアレイデータを用いた転写制御配列の予測」日本植物生理学会（熊本）2010.3.20

  5. 7.工藤久幸、山本義治、中邨真之、小保方潤一　「Pol ll の転写開始位置に関わるコード領域の役割」 日本分子生物学会年会（横浜）2009.12.12

  6. 6.吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、百町満朗、小林安文、小山博之、小林佑理子、井内聖、小林正智、坂井優作、山本義治　「植物プロモーター工場」日本分子生物学会年会（横浜）2009.12.12

  7. 5.吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、百町満朗、小林安文、小山博之、小林佑理子、井内聖、小林正智、山本義治　「マイクロアレイデータを用いたシス配列予測」日本植物病理学会関西支部会（神戸） 2009.10.18

  8. 4.吉岡洋平、Naznin Hushna Ara、山本義治、百町満朗「シロイヌナズナの全身的抵抗性誘導に関するマイクロアレイデータの比較解析」日本植物病理学会関西支部会（神戸） 2009.10.17~18

  9. 3.Naznin Hushna Ara, Yohei Yoshioka, Mitsuro Hyakumachi, Yoshiharu Y. Yamamoto. “Analysis of cis-regulatory elements in the promoters of genes related with disease resistance.” 日本植物病理学会関西支部会（神戸） 2009.10.17~18

  10. 2.山本義治、佐藤直樹、小保方潤一「植物プロモーターデータベースppdbの構築」日本育種学会秋季大会（札幌） 2009.9.26

  11. 1.山本義治、松尾充啓、小保方潤一　「シロイヌナズナ葉緑体ゲノム由来の核DNA（nupDNA）のプロモーター獲得について」日本遺伝学会年会（松本） 2009.9.16





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