gnuplotはデフォルトでは自動的にグラフの目盛り幅などを決める. atomeyeなどの原子配置ポジションと一致させたいときは二次元グラフはset size ratio -1だが 3次元のsplotではset view equal xyzとする

xy面に投影した,不安定モードの時間変化アニメーション


動画作成スクリプトのfortranプログラム

上記のプログラムだと,途中で負の原子がなくなるようなときに使いにくいためawkで作成する

【追記】データが間引かれるので,負の原子が存在しないときには(-1,-1,-1)に0,0,0のベクトル出力した ダミーデータをプロットする

3次元でのアニメーションと,近い視点で作成したatomeye動画

atomeyeの視点は数値で入力できないので完全に一致させることは難しい


動画作成スクリプトのfortranプログラム
3D用のawkスクリプト